此后陆续发现大量其它疾病与特定的HLA相关，其中， HLA-B27 抗原见于大约90%的 强直性脊椎炎 病人，以至使HLA分型具有了诊断价值，甚至，能较早地证实疾病亚型之间的临床区别，例如，寻常银屑病与HLA相关，而脓疱性银屑病则不然；青少年性 胰岛素依赖型糖尿病 与HLA-B8、HLA-Bw15和HLA-B18相关，而晚期发作型糖尿病并无这种相关。 因此，特定类型的HLA便成为某些疾病的遗传标志。

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