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目前主流蛋白质芯片的信号检测方式主要是荧光检测形体系。 将蛋白质芯片与荧光素标记的生物靶分子(核酸或蛋白质等)进行杂交,洗脱未结合组分后通过共聚焦荧光扫描仪或CCD荧光成像仪在特定的波长下激发荧光,获得反应结合的信号。 对荧光标记的芯片用共聚焦荧光显微镜进行扫描,然后通过计算机分析出每个点的平均荧光密度。