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如果是硕士论文查重的话，那么基本上跟本科论文是没有什么关系的，这个不需要担心。只要担心硕士论文就好了。

本科学生的论文是不需要查重的，只需要在写的时候让指导老师给一些指点就可以，只有硕士论文才需要查重，因为硕士论文的含金量比本科的要高一些。

本科和硕士的论文查重，首先它的查重率重复率的程度是不一样的，如果硕士论文重复率过高的话是不能够通过的，但是本科的话相对宽松一些。